Лауреат Государственных премий СССР, РСФСР и РФ, лауреат премии Правительства РФ, директор ГУ НИИ биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича РАМН, академик и член президиумв РАН,  доктор биологических наук, профессор

Родился 10 января 1940 года в городе Кашине Тверской области. Отец — Арчаков Иван Иванович (1901—1984). Мать — Полонская Елизавета Исааковна (1901—1995). Супруга — Лескова Светлана Григорьевна (1939 г. рожд.). Дочь — Арчакова Татьяна Александровна (1967 г. рожд.).

В 1962 году Александр Арчаков окончил лечебный факультет 2-го Московского государственного медицинского института имени Н.И. Пирогова и поступил в аспирантуру на кафедру биохимии этого вуза.
После окончания аспирантуры в 1965 году работал ассистентом, затем старшим преподавателем кафедры биохимии (1967—1970), старшим научным сотрудником (1970—1973), заведующим лабораторией энзимологии и биоэнергетики (1973—1979), заведующим кафедрой биохимии медико-биологического факультета 2-го Московского медицинского института имени Н.И. Пирогова (1979—1989).
С 1989 года по настоящее время — директор ГУ НИИ биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича РАМН.
А.И. Арчаков — один из ведущих в мире специалистов в области исследования молекулярных механизмов, структуры и функций мембран и биологического окисления. Разработка основных вопросов, связанных с проблемой микросомального окисления, исследование молекулярной организации и функционирования оксигеназных цитохром Р450-содержащих систем, химических механизмов повреждения мембран и способов их эффективной реконструкции — таковы исходные посылки, получившие развитие в работах Александра Ивановича и его сотрудников.

Фундаментальное изучение окислительной, обезвреживающей функции цитохрома Р450 послужило основой для создания ряда клинических тест-систем, биореакторов с заданным уровнем селективности, что позволило создать принципиально новые технологии для синтеза и анализа лекарственных соединений.
В работах А.И. Арчакова и сотрудников осуществлено всестороннее исследование семейства цитохром Р450-содержащих монооксигеназных систем биологических мембран. Методом пептидного сканирования получены антигенные карты мембраносвязанных бактериальных цитохромов Р450, что позволило осуществить компьютерное моделирование пространственных структур белков. Создана компьютерная база данных по семейству цитохромов Р450, которая содержит информацию о 240 семействах и подсемействах фермента.
На основе исследования механизмов межмолекулярного “узнавания” в реакциях белок-белкового и белок-липидного взаимодействий определены закономерности биологического функционирования белков в сложных системах.
Александр Иванович — один из пионеров и активный пропагандист идеологии “компьютерной биохимии”. В работах его школы построены компьютерные модели пространственных белковых структур, созданы антигенные “карты” иммунных детерминант организма и разработаны современные программы нового компьютерного дизайна важнейших лекарственных соединений и процессов, связанных с их активностью в организме.
Начиная с 1989 года в НИИ биомедицинской химии РАМН под научным и организационным руководством А.И. Арчакова сформировались новые направления исследований. Основным вектором деятельности научной школы А.И. Арчакова является изучение фундаментальных механизмов молекулярного “узнавания” в многокомпонентных ферментных системах. По его инициативе в институте создан ряд новых лабораторий, ориентированных на решение этих задач, которые составляют рабочую основу ныне действующей научной школы.
В научной школе А.И. Арчакова получены новые данные о кинетике взаимодействий компонентов монооксигеназной системы, о влиянии белок-белковых взаимодействий и роли в этих взаимодействиях гидрофобных и электростатических сил. Осуществлена реконструкция в водном растворе в отсутствии фосфолипидов цитохром Р450-содержащей монооксигеназной системы микросом печени. Выявлены определенные районы на поверхности молекул, ответственные за взаимодействия белков-партнеров монооксигеназной системы. Создана и постоянно пополняется компьютерная база данных по семействам цитохромов Р-450, содержащая самые полные сведения относительно этих и родственных им белков. С помощью этой базы данных и созданной в Институте компьютерной программы установлена общность структуры активного центра белков надсемейства цитохромов Р450.
Основная методология, используемая для решения этих проблем, — исследование структурно-функциональной организации макромолекул, определение локусов, ответственных за межмолекулярные контакты, моделирование этих взаимодействий и получение синтетических аналогов функционально важных фрагментов. Такие исследования стали возможны в связи с освоением в Институте самых современных методов компьютерной биохимии, биосенсорной, протеомной и генно-инженерной технологий.
Проводимые в последние годы в НИИ биомедицинской химии РАМН исследования по структурно-функциональному и молекулярно-графическому конструированию лекарств отражают передовой уровень современной биоинформатики. Практическим результатом этих исследований является создание новых ингибиторов цитохрома Р450 в микобактериях туберкулезной палочки, конструирование ингибиторов фолдинга протеазы ВИЧ, компьютерное конструирование синтетических вакцин вируса гепатита С и др. Эти работы имеют определяющее значение для создания лекарств нового поколения, тест-систем и диагностикумов.
Современные интересы А.И. Арчакова связаны с развитием протеомики — новой области науки, позволяющей осуществить инвентаризацию существующих белков в клетке. Развитие этой области исследований направлено на получение базовой информации об основных функциональных структурах живых систем и создание новых диагностических тестов в онкологии и лекарственных препаратов нового поколения. С 2001 года в НИИ биомедицинской химии РАМН работает оснащенный современной техникой первый в России центр протеомных исследований.
А.И. Арчаков — автор более 350 публикаций, из которых 6 монографий: “Перекисное окисление липидов в биологических мембранах” (1972), “Микросомальное окисление” (1975), “Оксигеназы биологических мембран” (1983), “Холестериноз” (1983), “Cholesterosis: membrane cholesterol, theoretical and clinical aspects” (1984), “Cytochrome P450 and active oxygen” (1990).
Под руководством Александра Ивановича защищены 15 докторских и 51 кандидатская диссертация.
В 1986 году А.И. Арчаков избран членом-корреспондентом АМН СССР, в 1991 году — действительным членом Российской академии медицинских наук. Он — член Президиума Российской академии медицинских наук, председатель Межведомственного научного совета по медицинской биохимии, член ряда экспертных советов по медико-биологическим проблемам при Министерстве науки и технологии РФ, член международных научных советов по “Микросомам и окислению лекарств”, “Биофизике и биохимии цитохрома Р450”, член научного совета международной организации “Протеом человека”, Международного союза по биохимии и молекулярной биологии. Член Нью-Йоркской академии наук, Биохимического общества Великобритании, Европейской академии наук.
А.И. Арчаков — лауреат Государственной премии СССР (1983) за цикл работ “Физико-химические механизмы свободнорадикального перекисного окисления липидов в биологических мембранах”, лауреат Государственной премии РСФСР (1989), лауреат Государственной премии РФ (1998) за цикл работ “Микросомальное окисление и метаболизм лекарств: механизмы оксигеназных реакций, катализируемых цитохромом Р450 и их моделирование”, лауреат Госудапрственной премии РФ (2021), лауреат премии Правительства РФ в области науки и техники (2002), лауреат премии имени А.Н. Баха Президиума АН СССР (1982) за серию работ “Микросомальное окисление”.
Награжден орденом “За заслуги перед Отечеством” IV степени (2000).
Живет и работает в Москве.